Se incorporó a la planta docente de la Facultad Latinoamericana de Ciencias Sociales, FLACSO Ecuador, en calidad de profesor asociado emérito.
El profesor Alier ha sido catedrático de la Universidad Autónoma de Barcelona desde 1975. Fue director del programa de Doctorado en Ciencias Ambientales del ICTA-UAB entre 1997 y 2009, donde ayudó a crear un importante grupo internacional sobre economía ecológica y ecología política.
Obtuvo su doctorado en la Universidad Autónoma de Barcelona.
Ha sido investigador del St. Antony’s College de Oxford y profesor visitante de la Universidad Libre de Berlin, Stanford University, Universidad de California (Davis), Yale University, FLACSO Ecuador y Universidade Estadual de Campinas (Sao Paulo).
Miembro fundador y presidente (2006-2007) de la Sociedad Internacional de Economía Ecológica y de la Asociación Europea de Economía Ambiental.
También ha sido miembro del comité científico de la Agencia Europea de Medio Ambiente.
Autor de numerosos libros y artículos que han contribuido a aclarar la relación entre los sistemas económicos, los recursos (materiales y energéticos) y los problemas sociales.
Ha sido un promotor fundamental para el desarrollo de la economía ecológica y se ha comprometido con los movimientos sociales a escala local e internacional.