Universidades Categoría A
• Escuela Politécnica Nacional (EPN)
• Escuela Superior Politécnica del Litoral (ESPOL)
• Universidad San Francisco de Quito (USFQ)
• Universidad de Cuenca (UC)
• Universidad de las Fuerzas Armadas (ESPE)
• Universidad de Especialidades Espíritu Santo (UEES)
• Universidad Andina Simón Bolívar (UASB)
• Facultad Latinoamericana de Ciencias Sociales (FLACSO).
Universidades Categoría B
• Escuela Superior Politécnica de Chimborazo
• Pontificia Universidad Católica del Ecuador
• Universidad Politécnica Estatal del Carchi
• Universidad Casa Grande
• Universidad Católica de Santiago de Guayaquil
• Universidad Central del Ecuador
• Universidad del Azuay
• Universidad Estatal de Milagro
• Universidad Nacional de Loja
• Universidad Particular Internacional Sek
• Universidad Politécnica Salesiana
• Universidad Técnica de Ambato
• Universidad Técnica del Norte
• Universidad Técnica Estatal de Quevedo
• Universidad Técnica Particular de Loja
• Universidad Tecnológica Empresarial de Guayaquil
• Universidad Tecnológica Equinoccial
• Universidad Tecnológica Indoamérica
• Universidad de los Hemisferios
• Universidad Estatal Amazónica
• Universidad Iberoamericana del Ecuador
• Universidad Técnica de Manabí
• Universidad de las Américas
• Universidad Internacional del Ecuador
•Instituto de Altos Estudios Nacionales (IAEN) la Universidad de Posgrado del Estado
Universidades Categoría C
• Escuela Superior Politécnica agropecuaria de Manabí
• Universidad de Especialidades Turísticas
• Universidad del Pacífico – Escuela de Negocios
• Universidad Estatal del Bolívar
• Universidad Laica Vicente Rocafuerte del Ecuador
• Universidad Metropolitana
• Universidad Nacional de Chimborazo
• Universidad de Especialidades Espíritu Santo
• Universidad Regional Autónoma de los Andes
• Universidad Técnica de Babahoyo
• Universidad Técnica de Israel
• Universidad Estatal Península Santa Elena
• Universidad Particular San Gregorio de Portoviejo
• Universidad Tecnológica Ecotec
• Universidad de Otavalo (Ascendió a categoría C en Octubre de 2016)
• Universidad Estatal del Sur de Manabí (Ascendió a categoría C en Octubre 2016)
Universidades Categoría D
• Universidad Agraria del Ecuador
• Universidad Laica Eloy Alfaro de Manabí
• Universidad Técnica Luis Vargas Torres de Esmeraldas
• Universidad Católica de Cuenca
La Universidad Técnica de Cotopaxi no alcanzó los estándares mínimos de calidad y el Consejo de Educación Superior (CES) lo intervino.
Universidades emblemáticas creadas en el actual Gobierno
• Universidad Yachay (Yachay Tech)
• Universidad de las Artes (UAres)
• Universidad Regional Amazónica (IKIAM)
• Universidad Nacional de Educación (UNAE)
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